213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0249 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  76.06 
 
 		 472 aa  706    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  961    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  70.06 
 
 		 473 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  66.95 
 
 		 472 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  64.09 
 
 		 484 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  61.86 
 
 		 491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  62.13 
 
 		 485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  61.57 
 
 		 491 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  61.65 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  61.57 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  62.89 
 
 		 485 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  62.34 
 
 		 485 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  61.43 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  53.39 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  50.53 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  26.41 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.56 
 
 		 865 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1402 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.29 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.52 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.73 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1032 aa  67.4  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.06 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.76 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.06 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.63 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.74 
 
 		 961 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1037 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.64 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  29.9 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.72 
 
 		 1059 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.54 
 
 		 831 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  32.39 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.43 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  26.86 
 
 		 267 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.58 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.15 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 976 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1493 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.54 
 
 		 1078 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.06 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  37.9 
 
 		 1086 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  26.54 
 
 		 1044 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.78 
 
 		 1263 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.96 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2413 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.26 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  29.82 
 
 		 613 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  34.09 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.14 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.09 
 
 		 860 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.25 
 
 		 557 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.29 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  31.82 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.73 
 
 		 593 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 		 172 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.2 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.19 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  29.19 
 
 		 817 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  27.97 
 
 		 731 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 599 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  35.77 
 
 		 1134 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  34.85 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  34.85 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1877 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  34.85 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 1261 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.88 
 
 		 685 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.94 
 
 		 565 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.22 
 
 		 1110 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  36.22 
 
 		 1105 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.3 
 
 		 218 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  28.37 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  37.21 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.56 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.22 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 997 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.03 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.05 
 
 		 1475 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  37.25 
 
 		 722 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.46 
 
 		 342 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.12 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.32 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  37.25 
 
 		 722 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.63 
 
 		 231 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 		 301 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1160 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.94 
 
 		 1260 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.19 
 
 		 363 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  32.61 
 
 		 1105 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 223 aa  50.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  31 
 
 		 184 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  30.43 
 
 		 357 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  27.27 
 
 		 232 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>