248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3592 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 472 aa  959    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  65.82 
 
 		 473 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  68.43 
 
 		 472 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  66.95 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  63.6 
 
 		 485 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  62.4 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  62.19 
 
 		 491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  61.78 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  63.6 
 
 		 485 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  64.78 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  63.81 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  62.4 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  60.96 
 
 		 484 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  53.78 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  50.96 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  26.19 
 
 		 544 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1032 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.89 
 
 		 831 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 865 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  35.81 
 
 		 1059 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.72 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1160 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.2 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 		 859 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  29.23 
 
 		 679 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.61 
 
 		 961 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 		 346 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1402 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.25 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.31 
 
 		 2413 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  38.98 
 
 		 1086 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1037 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  29.63 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.81 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27 
 
 		 1493 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  37.29 
 
 		 1134 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.72 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.81 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  36.44 
 
 		 1105 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.44 
 
 		 1110 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  34.29 
 
 		 1105 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.11 
 
 		 685 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 976 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 		 172 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.14 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.44 
 
 		 1263 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  31.84 
 
 		 839 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.19 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.21 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.91 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 860 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.14 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  32.54 
 
 		 913 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.45 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1002 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.03 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.34 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.44 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.61 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.93 
 
 		 382 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.7 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  27 
 
 		 1366 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 254 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.09 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.74 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.19 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.26 
 
 		 1260 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.12 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1877 aa  54.3  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 181 aa  54.7  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.92 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.11 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  25.75 
 
 		 1044 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  28.05 
 
 		 817 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.23 
 
 		 523 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.24 
 
 		 256 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 358 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 		 184 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  25.46 
 
 		 789 aa  53.5  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.19 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  31.68 
 
 		 184 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  31.68 
 
 		 184 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.75 
 
 		 1078 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  31.68 
 
 		 184 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  31.5 
 
 		 247 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.7 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.72 
 
 		 255 aa  53.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 223 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  36.71 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.81 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.69 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  33 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 1261 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  28.95 
 
 		 246 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>