191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3451 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  949    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  50.96 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  50.41 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  50.21 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  50.1 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  49.58 
 
 		 485 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  49.59 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  50.63 
 
 		 484 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  50.53 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  49.79 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  49.9 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  50.53 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  49.57 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  44 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  25.91 
 
 		 544 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1402 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.36 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.64 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.73 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.17 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.89 
 
 		 961 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.83 
 
 		 831 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 		 865 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.65 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 		 565 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  67  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.61 
 
 		 684 aa  67  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 976 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1877 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.68 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  26.97 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  26.5 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.14 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.33 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.71 
 
 		 2413 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.36 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1493 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.51 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  26.15 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.91 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.67 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.04 
 
 		 838 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.75 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.8 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.5 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  25.18 
 
 		 1044 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.51 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  31.39 
 
 		 221 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 1072 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.18 
 
 		 1078 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.17 
 
 		 685 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1037 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  28.76 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.09 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  26.04 
 
 		 233 aa  57  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  24.64 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 1430 aa  56.6  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  27.16 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.78 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  27.18 
 
 		 232 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  28.34 
 
 		 264 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 252 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  27.16 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  28.76 
 
 		 511 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1032 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.92 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.92 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.12 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  34.72 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.38 
 
 		 528 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  27.08 
 
 		 731 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.06 
 
 		 254 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  31.5 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1002 aa  53.9  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  26.7 
 
 		 328 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  27.88 
 
 		 511 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 		 321 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  29.19 
 
 		 276 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  27.45 
 
 		 552 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.38 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.14 
 
 		 680 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  33.75 
 
 		 252 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.57 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1366 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  29.41 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.51 
 
 		 679 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.89 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  27.33 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  25.6 
 
 		 303 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 223 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.07 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1275 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.43 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>