280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0192 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  76.63 
 
 
484 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  99.19 
 
 
491 aa  999    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  98.37 
 
 
491 aa  992    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
491 aa  1009    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  77.1 
 
 
485 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  76.69 
 
 
485 aa  768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  79.72 
 
 
484 aa  797    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  76.89 
 
 
485 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  98.78 
 
 
491 aa  995    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  62.6 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  62.4 
 
 
473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  63.43 
 
 
472 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  61.57 
 
 
471 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  53.69 
 
 
502 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  50.21 
 
 
475 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  22.9 
 
 
544 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.98 
 
 
831 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.08 
 
 
865 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.77 
 
 
1402 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.92 
 
 
961 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.93 
 
 
684 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.4 
 
 
731 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.75 
 
 
376 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.05 
 
 
376 aa  67  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.82 
 
 
235 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.44 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  36.59 
 
 
552 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
976 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.44 
 
 
490 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.75 
 
 
1877 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  36.59 
 
 
202 aa  64.3  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 
393 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.37 
 
 
329 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
448 aa  63.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.49 
 
 
528 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.54 
 
 
343 aa  63.5  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  30.65 
 
 
536 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.5 
 
 
557 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  23.93 
 
 
789 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.69 
 
 
255 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.8 
 
 
860 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34 
 
 
256 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.91 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
1032 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.51 
 
 
1493 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.23 
 
 
208 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  22.8 
 
 
373 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
252 aa  60.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.76 
 
 
839 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.94 
 
 
565 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
599 aa  60.1  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  35.25 
 
 
1086 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.67 
 
 
679 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
223 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  22.8 
 
 
373 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26 
 
 
680 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  33.61 
 
 
613 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.34 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 
593 aa  58.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  30.1 
 
 
172 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  39.47 
 
 
329 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  31.47 
 
 
228 aa  57.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 
318 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.29 
 
 
2413 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 
359 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  39.47 
 
 
328 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  24.54 
 
 
305 aa  57  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.61 
 
 
1059 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.45 
 
 
254 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.22 
 
 
838 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.8 
 
 
221 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  34.65 
 
 
184 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  32 
 
 
231 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.61 
 
 
1263 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
181 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  31.82 
 
 
304 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
859 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.44 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  28.44 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  29.86 
 
 
276 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.41 
 
 
382 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  34.65 
 
 
184 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  34.65 
 
 
184 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  34.65 
 
 
184 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
117 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  27.44 
 
 
358 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01554  activator of chitin synthase (Eurofung)  30.25 
 
 
702 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.158425  normal  0.055064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 
278 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.4 
 
 
241 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 
512 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.83 
 
 
586 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 
184 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 
1003 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001090  fOG: TPR repeat protein SEL1 subfamily  28.57 
 
 
398 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.9 
 
 
294 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  35.9 
 
 
294 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
415 aa  54.3  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>