More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81785 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  100 
 
 
613 aa  1272    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01554  activator of chitin synthase (Eurofung)  35.49 
 
 
702 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.158425  normal  0.055064 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02680  protoplast regeneration and killer toxin resistance gene, putative  34.87 
 
 
490 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.732137  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08765  activator of chitin synthase (Eurofung)  37.39 
 
 
807 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.061785  normal  0.272195 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03420  enzyme activator, putative  33.8 
 
 
754 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.85 
 
 
961 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.04 
 
 
1402 aa  127  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.89 
 
 
831 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.58 
 
 
684 aa  124  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.77 
 
 
789 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.42 
 
 
1037 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.77 
 
 
393 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03445  chitin synthase activator (Chs3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05580)  25.08 
 
 
723 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.62 
 
 
865 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.79 
 
 
380 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.68 
 
 
305 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.93 
 
 
1493 aa  101  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.8 
 
 
489 aa  99  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30 
 
 
490 aa  97.8  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.68 
 
 
490 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.76 
 
 
342 aa  94.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.03 
 
 
1002 aa  94  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 
763 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  26.95 
 
 
380 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.42 
 
 
373 aa  90.9  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
1430 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.95 
 
 
528 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.62 
 
 
523 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.67 
 
 
1877 aa  89  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  23.57 
 
 
557 aa  87.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.06 
 
 
373 aa  87  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  27.47 
 
 
591 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  27.65 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
1032 aa  85.5  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.54 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  23.76 
 
 
482 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.86 
 
 
1200 aa  83.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
448 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  26.78 
 
 
552 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.72 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.88 
 
 
346 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.69 
 
 
1281 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.72 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  27.48 
 
 
1200 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.55 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.54 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.59 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  29.59 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  27.47 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  28.67 
 
 
961 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.34 
 
 
2413 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.09 
 
 
850 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  28.89 
 
 
325 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.96 
 
 
267 aa  79.7  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 
971 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  24.92 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.94 
 
 
218 aa  79  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.81 
 
 
512 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  32.74 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  24.69 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  24.69 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.96 
 
 
890 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  24.69 
 
 
509 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  25.93 
 
 
971 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  24.69 
 
 
509 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.27 
 
 
679 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  77  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  28.84 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  24.61 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.01 
 
 
811 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  22.69 
 
 
693 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  27.34 
 
 
685 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 
246 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  24.61 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  26.76 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.02 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.97 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  25.35 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  27.34 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  33.9 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  26.49 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.59 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.58 
 
 
235 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.97 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.86 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.43 
 
 
271 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.01 
 
 
343 aa  73.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
798 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  26.78 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  27.78 
 
 
358 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  34.64 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.96 
 
 
860 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
976 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.28 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.51 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.65 
 
 
680 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.77 
 
 
731 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.9 
 
 
278 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>