More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02680 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE02680  protoplast regeneration and killer toxin resistance gene, putative  100 
 
 
490 aa  1018    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.732137  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01554  activator of chitin synthase (Eurofung)  51.75 
 
 
702 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.158425  normal  0.055064 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03420  enzyme activator, putative  41.85 
 
 
754 aa  292  8e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08765  activator of chitin synthase (Eurofung)  45.85 
 
 
807 aa  286  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.061785  normal  0.272195 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  35.91 
 
 
613 aa  263  4e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 
763 aa  133  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03445  chitin synthase activator (Chs3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05580)  27.42 
 
 
723 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.93 
 
 
961 aa  123  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.34 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.49 
 
 
831 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.03 
 
 
380 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.06 
 
 
789 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.14 
 
 
1402 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.82 
 
 
393 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.23 
 
 
684 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.05 
 
 
318 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
448 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 
557 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.38 
 
 
1493 aa  98.2  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.81 
 
 
373 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.02 
 
 
376 aa  96.7  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.02 
 
 
376 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.81 
 
 
373 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
1032 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.92 
 
 
1877 aa  94  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.35 
 
 
685 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
1430 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 
523 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.82 
 
 
1037 aa  90.9  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.59 
 
 
380 aa  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.62 
 
 
865 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.24 
 
 
490 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.96 
 
 
346 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.67 
 
 
490 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.01 
 
 
305 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 
343 aa  87  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.88 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  25.18 
 
 
1002 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  29.9 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  39.2 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  25.92 
 
 
680 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.28 
 
 
2413 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.16 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  29.43 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.68 
 
 
850 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.55 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.62 
 
 
1200 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.26 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.62 
 
 
1200 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.24 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  28.47 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.71 
 
 
731 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.09 
 
 
255 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.13 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.76 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 
890 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.39 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.75 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  24.71 
 
 
1281 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  33.52 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.27 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
976 aa  73.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.03 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  23.49 
 
 
1141 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.47 
 
 
1263 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.35 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.37 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.96 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  37.4 
 
 
365 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.32 
 
 
1261 aa  70.1  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.05 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.46 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  28.12 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
705 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  29.36 
 
 
961 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
252 aa  69.3  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.71 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.03 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
1196 aa  68.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.03 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  28.68 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  27.68 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.68 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.68 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.61 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.87 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.03 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  23.14 
 
 
693 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.03 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  37.6 
 
 
184 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  37.6 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  37.6 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.7 
 
 
464 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  37.6 
 
 
184 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>