More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03420 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF03420  enzyme activator, putative  100 
 
 
754 aa  1554    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08765  activator of chitin synthase (Eurofung)  50.82 
 
 
807 aa  346  8e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.061785  normal  0.272195 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02680  protoplast regeneration and killer toxin resistance gene, putative  45.4 
 
 
490 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.732137  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01554  activator of chitin synthase (Eurofung)  39.94 
 
 
702 aa  249  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.158425  normal  0.055064 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  33.8 
 
 
613 aa  193  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03445  chitin synthase activator (Chs3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05580)  30.88 
 
 
723 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  34.45 
 
 
763 aa  140  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.4 
 
 
1402 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.85 
 
 
684 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.18 
 
 
961 aa  122  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.55 
 
 
489 aa  118  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.1 
 
 
380 aa  116  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 
831 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.96 
 
 
393 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.23 
 
 
789 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
448 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.16 
 
 
1037 aa  107  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.85 
 
 
557 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.07 
 
 
373 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 
318 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
1430 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.39 
 
 
1002 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.07 
 
 
373 aa  104  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.26 
 
 
1493 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.79 
 
 
685 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 
341 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.01 
 
 
490 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.96 
 
 
376 aa  99.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.09 
 
 
490 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.62 
 
 
376 aa  99.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.02 
 
 
343 aa  96.3  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.92 
 
 
358 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.52 
 
 
1877 aa  94.4  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.19 
 
 
380 aa  93.6  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  29.51 
 
 
1078 aa  90.9  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
976 aa  90.9  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.51 
 
 
1044 aa  90.5  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.2 
 
 
305 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.67 
 
 
2413 aa  89  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
523 aa  88.2  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  31.15 
 
 
961 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  28.94 
 
 
380 aa  87.4  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.37 
 
 
392 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.86 
 
 
267 aa  86.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
1032 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.04 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  29.09 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  35.11 
 
 
839 aa  84  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.23 
 
 
680 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 
940 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.96 
 
 
325 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.53 
 
 
235 aa  82  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  28.96 
 
 
325 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  29.46 
 
 
416 aa  82  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.56 
 
 
838 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  39.32 
 
 
1141 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.96 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  36.49 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.77 
 
 
890 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  27.8 
 
 
971 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
303 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.66 
 
 
346 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.3 
 
 
359 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  33.15 
 
 
234 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.38 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.54 
 
 
278 aa  79.7  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
971 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.1 
 
 
264 aa  80.1  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  23.8 
 
 
1281 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.67 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.51 
 
 
865 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.43 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.16 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  28.17 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  29.79 
 
 
342 aa  77.4  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  28.92 
 
 
540 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
252 aa  77  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.15 
 
 
245 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.03 
 
 
552 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.18 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.23 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  29.5 
 
 
679 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  28.19 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.42 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.12 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  30.7 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.8 
 
 
512 aa  74.7  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 
705 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  28.47 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.92 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.81 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.16 
 
 
509 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.7 
 
 
482 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 
509 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  30.81 
 
 
509 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.16 
 
 
509 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.53 
 
 
270 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.75 
 
 
1200 aa  72.8  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>