More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3208 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1131    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  26.41 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  26.19 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  23.19 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  22.9 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  22.9 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  25.38 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  23.01 
 
 		 484 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.19 
 
 		 491 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  25.91 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  29.94 
 
 		 502 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  24.92 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.91 
 
 		 684 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  23.44 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  23.15 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  23.15 
 
 		 485 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.32 
 
 		 961 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  28.87 
 
 		 789 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  22.92 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.8 
 
 		 838 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.47 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1037 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1402 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.92 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.23 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  24.05 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.46 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 976 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  28.46 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  28.47 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.88 
 
 		 890 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1493 aa  57  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.03 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.83 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.45 
 
 		 680 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  23.83 
 
 		 831 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.38 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  30.08 
 
 		 346 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  26.17 
 
 		 368 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.57 
 
 		 865 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  26.75 
 
 		 229 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  30.08 
 
 		 357 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1877 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 910 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.23 
 
 		 380 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1366 aa  52.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 933 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.36 
 
 		 679 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.11 
 
 		 811 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  34.43 
 
 		 830 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  81.82 
 
 		 901 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  22.56 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 162 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  26.83 
 
 		 212 aa  52  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  32.5 
 
 		 170 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  27.97 
 
 		 368 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 844 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  28.68 
 
 		 231 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.88 
 
 		 363 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 838 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 913 aa  50.4  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 916 aa  50.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  65.52 
 
 		 909 aa  50.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 881 aa  50.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  22 
 
 		 344 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 912 aa  50.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 858 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 921 aa  50.4  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 833 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 922 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  26.95 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  53.12 
 
 		 836 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 164 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 864 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 894 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  47.62 
 
 		 235 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  44.19 
 
 		 236 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  51.43 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 164 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  29.63 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3856  Sel1 domain-containing protein  24.49 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  51.43 
 
 		 228 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 162 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.09 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  26.35 
 
 		 837 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  27.7 
 
 		 940 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  36.62 
 
 		 222 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  34.67 
 
 		 154 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.79 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 893 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 834 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  29.63 
 
 		 295 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 921 aa  48.9  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>