More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2736 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  100 
 
 
162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  73.03 
 
 
165 aa  228  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  56.79 
 
 
162 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  49.38 
 
 
170 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  47.83 
 
 
162 aa  158  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  47.5 
 
 
161 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  49.06 
 
 
163 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  43.9 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  50.94 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  43.29 
 
 
164 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  45.68 
 
 
160 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  43.21 
 
 
160 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  46.2 
 
 
166 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  42.86 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  46.84 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  47.85 
 
 
155 aa  136  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  40.88 
 
 
159 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  40.25 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  44.03 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  44.51 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  43.4 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  43.4 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  43.4 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  43.4 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  43.4 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  44.17 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  43.4 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  43.4 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  47.56 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  41.61 
 
 
169 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  46.25 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  42.14 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  43.75 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  42.68 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  43.83 
 
 
155 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  42.68 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  44.72 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  42.11 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  42.68 
 
 
158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  41.88 
 
 
158 aa  121  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  41.36 
 
 
162 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.31 
 
 
160 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  43.11 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  38.99 
 
 
168 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  38.99 
 
 
168 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  38.99 
 
 
168 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  44.03 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  38.36 
 
 
168 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  38.99 
 
 
168 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  39.38 
 
 
158 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  42.77 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  44.59 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  39.51 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  39.51 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  38.51 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  38.12 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  40.96 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  46.88 
 
 
131 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  40.12 
 
 
155 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  50.39 
 
 
127 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  44.36 
 
 
129 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  47.66 
 
 
129 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 
163 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  37.74 
 
 
159 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  37.35 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  36.25 
 
 
158 aa  99  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  36.69 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  37.27 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  98.2  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  46.77 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  43.75 
 
 
128 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  45.38 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  43.2 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  35.93 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1547  ribosomal protein L20  43.48 
 
 
134 aa  94.4  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  37.11 
 
 
163 aa  94.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  36.08 
 
 
153 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  37.2 
 
 
159 aa  94  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  36.02 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  35.5 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  31.93 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  35.85 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  34.38 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  35.63 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  35.63 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  45.6 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  46.34 
 
 
132 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  34.29 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  34.29 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  44.19 
 
 
121 aa  88.6  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  33.71 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  44.19 
 
 
129 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  41.41 
 
 
127 aa  87.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  46.09 
 
 
132 aa  87.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>