More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0448 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  99.32 
 
 		 295 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  98.98 
 
 		 295 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  99.32 
 
 		 295 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  99.32 
 
 		 295 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  99.32 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  98.98 
 
 		 294 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  86.73 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  65.67 
 
 		 267 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  65.43 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  64.81 
 
 		 267 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  65.06 
 
 		 285 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0401  Sel1 domain-containing protein  63.94 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27663  hitchhiker  0.00849868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  62.45 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  62.45 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6245  Sel1 repeat-containing protein  67.67 
 
 		 281 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  67.67 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3362  hypothetical protein  66.09 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  43.72 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.53 
 
 		 489 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.05 
 
 		 961 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.38 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.58 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.29 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  42.74 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.82 
 
 		 684 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.18 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1402 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1493 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31 
 
 		 789 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.07 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  39.09 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.3 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  40.3 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.02 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.66 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 		 705 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  36.97 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  42.11 
 
 		 839 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.46 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.42 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.53 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.48 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  42.71 
 
 		 1275 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.33 
 
 		 811 aa  69.3  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  38.22 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.99 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.94 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.66 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  40.78 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  38.33 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.96 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  40.78 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.67 
 
 		 798 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  40.78 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  40.78 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.35 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.72 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.77 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1002 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.72 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  31.72 
 
 		 509 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.04 
 
 		 1344 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.06 
 
 		 838 aa  67  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  44.76 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.99 
 
 		 731 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.72 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 1012 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.82 
 
 		 2413 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1281 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1141 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.24 
 
 		 1110 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 1261 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1032 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.87 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.01 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.07 
 
 		 552 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  35.25 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.54 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.69 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.25 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  31.53 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.19 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.5 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.51 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.95 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 890 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.34 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.38 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 		 1430 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>