More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3443 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
248 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3379  Sel1 domain protein repeat-containing protein  97.98 
 
 
248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.287446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3301  Sel1  96.37 
 
 
261 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.89 
 
 
831 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.76 
 
 
382 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.16 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.94 
 
 
1002 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  38.41 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.48 
 
 
961 aa  89.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.94 
 
 
305 aa  88.6  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.87 
 
 
489 aa  88.6  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.04 
 
 
1402 aa  88.6  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.72 
 
 
557 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.84 
 
 
393 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.47 
 
 
358 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  40.27 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.51 
 
 
343 aa  86.3  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.88 
 
 
1493 aa  85.9  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.55 
 
 
185 aa  86.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  32.56 
 
 
328 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.1 
 
 
693 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  32.8 
 
 
509 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  32.8 
 
 
509 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.67 
 
 
392 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.69 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.91 
 
 
789 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34 
 
 
346 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  39.3 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.38 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  32.26 
 
 
509 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  32.04 
 
 
1200 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  32.04 
 
 
1200 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  32.26 
 
 
509 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.97 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.45 
 
 
380 aa  82  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  41.8 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.94 
 
 
684 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.59 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0793  hypothetical protein  40.98 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.303568  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.85 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.61 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
1032 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.47 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.01 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.13 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.67 
 
 
1037 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.29 
 
 
464 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.81 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.52 
 
 
838 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
303 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.83 
 
 
347 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 
890 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.94 
 
 
490 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.05 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.14 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.96 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  31.02 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.69 
 
 
865 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  35.33 
 
 
368 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  34.4 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.26 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.3 
 
 
490 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.06 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.36 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.94 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  34 
 
 
416 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.94 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1608  hypothetical protein  39.67 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  40.98 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  29.65 
 
 
425 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.21 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.18 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.38 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.2 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.76 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.76 
 
 
798 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  38.41 
 
 
961 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  39.52 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.87 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.98 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  38.84 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.76 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  25 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  27.45 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.28 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.32 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>