More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2952 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  97.89 
 
 		 285 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  89.12 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  89.12 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6245  Sel1 repeat-containing protein  90.39 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  90.04 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0401  Sel1 domain-containing protein  85.82 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27663  hitchhiker  0.00849868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  62.71 
 
 		 322 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.4 
 
 		 267 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.4 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  69.4 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  69.4 
 
 		 294 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  69.4 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  69.4 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  69.4 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  69.4 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  68.97 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3362  hypothetical protein  66.37 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  45.81 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.66 
 
 		 961 aa  86.7  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1402 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.31 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.12 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.01 
 
 		 489 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.18 
 
 		 684 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  36.08 
 
 		 839 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.4 
 
 		 789 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.81 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  44.55 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.94 
 
 		 831 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.98 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  45.37 
 
 		 505 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.72 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  47.19 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.52 
 
 		 685 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.68 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.84 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.68 
 
 		 557 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.11 
 
 		 425 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.88 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.05 
 
 		 509 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.67 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.94 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  30.73 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.09 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.7 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1101  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.8 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.78 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.77 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.91 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1493 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.55 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.16 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.77 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1281 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  31.18 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.85 
 
 		 811 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.54 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  40.54 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  41.44 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  38.02 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1796 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.21 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  37.69 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1877 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1002 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.78 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.44 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.48 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.48 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.59 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.4 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.46 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.37 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.09 
 
 		 865 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 1012 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.02 
 
 		 2413 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.17 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.63 
 
 		 731 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 705 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.45 
 
 		 961 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.22 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  33.75 
 
 		 746 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.66 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  31.21 
 
 		 536 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.65 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>