More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2814 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  97.89 
 
 		 285 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  88.07 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  88.07 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  88.97 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6245  Sel1 repeat-containing protein  88.97 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0401  Sel1 domain-containing protein  84.75 
 
 		 282 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27663  hitchhiker  0.00849868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  62.12 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  66.96 
 
 		 267 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  66.96 
 
 		 267 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  68.97 
 
 		 294 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  68.97 
 
 		 294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  68.97 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  68.97 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  68.97 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  68.97 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  68.53 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3362  hypothetical protein  66.81 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  46.05 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1402 aa  87  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.16 
 
 		 961 aa  85.9  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.52 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.12 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  36.08 
 
 		 839 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.18 
 
 		 684 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.81 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  44.55 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.14 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.98 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  45.37 
 
 		 505 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.05 
 
 		 831 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34 
 
 		 376 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.68 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  38.4 
 
 		 685 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  47.19 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.03 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.72 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.5 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.68 
 
 		 557 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 509 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.94 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 509 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.67 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1493 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.08 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.81 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.77 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1101  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.04 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.91 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.85 
 
 		 811 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1281 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.8 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.16 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.64 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  38.02 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.86 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.11 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1796 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.25 
 
 		 490 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  40.54 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1002 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.78 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  36.28 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.82 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.59 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.17 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  32.35 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.48 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1877 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.46 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  39.86 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 705 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.73 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.79 
 
 		 961 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.65 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.27 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 1012 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 		 865 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.22 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.48 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.63 
 
 		 731 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.03 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  36.25 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.17 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>