More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0573 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  100 
 
 		 267 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.56 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.56 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3362  hypothetical protein  49.78 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  44.54 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  42.79 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  42.79 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  43.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  43.72 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  43.72 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  43.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  43.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  43.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  43.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  44.54 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  44.1 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  44.1 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6245  Sel1 repeat-containing protein  43.75 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0401  Sel1 domain-containing protein  40.42 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27663  hitchhiker  0.00849868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1402 aa  85.5  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.32 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.8 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.56 
 
 		 684 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.73 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.68 
 
 		 831 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 1032 aa  79  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.98 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1493 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1101  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.94 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126801  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.03 
 
 		 961 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.57 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1281 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.86 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1366 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.56 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.05 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.17 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.88 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 976 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.53 
 
 		 2413 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.09 
 
 		 865 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.87 
 
 		 425 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  39.16 
 
 		 839 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.81 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.45 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.81 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.81 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.69 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.09 
 
 		 850 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.28 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.49 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.42 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  37.06 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1002 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.49 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.49 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  40.6 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.2 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  32.02 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.98 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.97 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  32.02 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.65 
 
 		 482 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.46 
 
 		 1263 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  29.31 
 
 		 1200 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.51 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1877 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  30 
 
 		 765 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  32.7 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.35 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.57 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  40.87 
 
 		 1910 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  29.31 
 
 		 1200 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  39.56 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.04 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.17 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.09 
 
 		 997 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.45 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0241  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.35 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.381439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.15 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.94 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.95 
 
 		 1012 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  34.81 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.16 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.92 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.37 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>