278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3960 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 473 aa  964    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  70.06 
 
 		 471 aa  634    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  65.82 
 
 		 472 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  68.42 
 
 		 472 aa  631  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  62.14 
 
 		 491 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  61.98 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  62 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  62.14 
 
 		 491 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  61.93 
 
 		 491 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  61.09 
 
 		 485 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  62.05 
 
 		 484 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  61.72 
 
 		 485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  61.3 
 
 		 485 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  55.38 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  50.53 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  25.38 
 
 		 544 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.86 
 
 		 865 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 831 aa  73.2  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  27.83 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.22 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1402 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.13 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.73 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.73 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1032 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.75 
 
 		 1037 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2413 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.12 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.57 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.38 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.03 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.04 
 
 		 172 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.68 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  34.9 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 976 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 817 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.95 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.95 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.32 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.06 
 
 		 1263 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.81 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.68 
 
 		 245 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.83 
 
 		 1110 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.97 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.21 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 1430 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  28.76 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1877 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.23 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.61 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.98 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  34.45 
 
 		 1134 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  29.78 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  34.45 
 
 		 1086 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1160 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.65 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.37 
 
 		 208 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.32 
 
 		 961 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.91 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.99 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.85 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1366 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  33.61 
 
 		 1105 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  27.96 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  31.95 
 
 		 1242 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.67 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.81 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1796 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  24.57 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  36.21 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.33 
 
 		 341 aa  57  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.02 
 
 		 363 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  32.62 
 
 		 763 aa  57  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 382 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.83 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.57 
 
 		 368 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1493 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.56 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1275 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  27.96 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.97 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.37 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  27.49 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  30.43 
 
 		 613 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  29.11 
 
 		 185 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.83 
 
 		 232 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  32.46 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.8 
 
 		 838 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>