More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3510 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  67.06 
 
 		 511 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  82.42 
 
 		 514 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  66.47 
 
 		 511 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1048    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  96.68 
 
 		 512 aa  993    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0538  hypothetical protein  70.7 
 
 		 512 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  95.7 
 
 		 512 aa  983    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.06 
 
 		 511 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  66.86 
 
 		 511 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  32.2 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.57 
 
 		 961 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.39 
 
 		 684 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1402 aa  121  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.53 
 
 		 831 aa  116  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1037 aa  109  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  28.79 
 
 		 789 aa  103  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1877 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  29.96 
 
 		 425 aa  99.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.28 
 
 		 557 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.97 
 
 		 838 aa  96.3  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.98 
 
 		 392 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.89 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.43 
 
 		 490 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.29 
 
 		 490 aa  94  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 		 316 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.97 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1032 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  31.17 
 
 		 301 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.69 
 
 		 341 aa  91.3  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.27 
 
 		 865 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.97 
 
 		 256 aa  90.9  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.98 
 
 		 373 aa  90.5  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.98 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.15 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.37 
 
 		 343 aa  88.6  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.25 
 
 		 376 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 976 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.56 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.68 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  26.69 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  27.95 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25 
 
 		 1493 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.38 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.22 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.24 
 
 		 890 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.31 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.08 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.09 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  29.86 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  27.99 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.43 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  26.01 
 
 		 1200 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  25.74 
 
 		 1200 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.9 
 
 		 685 aa  77.4  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.43 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.89 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  27.84 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.78 
 
 		 680 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  30.99 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.98 
 
 		 2413 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  26.52 
 
 		 985 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.1 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  30.67 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.77 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  24.52 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  26.72 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  27.06 
 
 		 839 aa  73.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.09 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  25.59 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  25.89 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.02 
 
 		 811 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.67 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1002 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  30.8 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  25.89 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  25.89 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.6 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.22 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  30.65 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.52 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.68 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.38 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  34.15 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  35.77 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  28.33 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.11 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  40.2 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  26.24 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  25.28 
 
 		 850 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  32.89 
 
 		 304 aa  67  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>