269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0538 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  74.51 
 
 		 511 aa  745    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  73.14 
 
 		 514 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  74.71 
 
 		 511 aa  748    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  70.7 
 
 		 512 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  70.9 
 
 		 512 aa  727    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  71.09 
 
 		 512 aa  727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  74.71 
 
 		 511 aa  750    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1041    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  75.1 
 
 		 511 aa  751    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.22 
 
 		 961 aa  117  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.12 
 
 		 684 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1402 aa  106  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.57 
 
 		 831 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  25.65 
 
 		 789 aa  94.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.73 
 
 		 392 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.04 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.85 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1037 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.99 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.85 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1877 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  27.66 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.53 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.28 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.46 
 
 		 2413 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  28.8 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.68 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.95 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 976 aa  80.1  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.11 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.96 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  25.43 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  23.81 
 
 		 331 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  24.12 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.75 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 		 890 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.08 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.06 
 
 		 865 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1493 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  23.51 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  24.27 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.16 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1032 aa  73.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.45 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  23.21 
 
 		 331 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.84 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.06 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.61 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  31.31 
 
 		 301 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 664 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.86 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.55 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.19 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  27.55 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.9 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.5 
 
 		 1078 aa  67  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.81 
 
 		 523 aa  67  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.92 
 
 		 811 aa  66.6  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  26.5 
 
 		 1044 aa  66.6  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  26.42 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.73 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  28.02 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30.39 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.83 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.41 
 
 		 971 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  26.37 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.99 
 
 		 731 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.39 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  24.05 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.83 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  24.05 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.7 
 
 		 1200 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  29.83 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.43 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 		 971 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  25.58 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  24.05 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.4 
 
 		 1200 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  28.1 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  24.05 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.29 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.83 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.05 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  25.67 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  26.02 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.57 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  33.87 
 
 		 221 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>