More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4139 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0538  hypothetical protein  73.14 
 
 		 512 aa  729    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1046    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  70 
 
 		 511 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  70.2 
 
 		 511 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  70 
 
 		 511 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  82.42 
 
 		 512 aa  842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  82.23 
 
 		 512 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  69.61 
 
 		 511 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  82.03 
 
 		 512 aa  835    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 504 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.52 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.82 
 
 		 961 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.96 
 
 		 831 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1037 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.38 
 
 		 789 aa  103  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.72 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.26 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.07 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.17 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1877 aa  97.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.65 
 
 		 392 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.03 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.44 
 
 		 2413 aa  92  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 		 341 aa  91.3  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  25.59 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.2 
 
 		 256 aa  90.9  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.62 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.14 
 
 		 343 aa  90.1  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.47 
 
 		 316 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  29.03 
 
 		 1200 aa  87.8  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.48 
 
 		 865 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.8 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.33 
 
 		 838 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.39 
 
 		 1200 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1032 aa  84.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1493 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.76 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.67 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.65 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  23 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.17 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.76 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.3 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 976 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  29.03 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.58 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.05 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.55 
 
 		 685 aa  80.1  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 		 890 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  23.82 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  27.55 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.28 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.49 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  23.82 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  23.82 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.76 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.43 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1002 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  24.36 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.21 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.52 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.24 
 
 		 680 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  28.96 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.88 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.19 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.13 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  28.73 
 
 		 591 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.09 
 
 		 693 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.08 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  25.78 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.79 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  23.11 
 
 		 961 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.68 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 		 278 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.26 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  27.82 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  26.9 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.98 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.15 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  29.69 
 
 		 1078 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.69 
 
 		 1044 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.5 
 
 		 811 aa  67.4  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  28 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  29.5 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 1012 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1281 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.56 
 
 		 321 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  27.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.72 
 
 		 325 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.72 
 
 		 325 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.29 
 
 		 276 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>