More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4559 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  991    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  76.37 
 
 		 491 aa  756    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  76.22 
 
 		 491 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  76.42 
 
 		 491 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  76.42 
 
 		 491 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  91.12 
 
 		 485 aa  882    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  90.91 
 
 		 485 aa  899    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  90.91 
 
 		 485 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  76.23 
 
 		 484 aa  761    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  64.78 
 
 		 472 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  64.51 
 
 		 472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  62.05 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  61.43 
 
 		 471 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  55.25 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  50.63 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 1032 aa  84  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 831 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  22.92 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.02 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.8 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1402 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.33 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.52 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 865 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30 
 
 		 961 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.05 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  27.73 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  67  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.55 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  31.43 
 
 		 231 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.73 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.69 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.43 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.03 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 976 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.22 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.77 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.69 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 		 860 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.98 
 
 		 256 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.06 
 
 		 731 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 		 859 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.95 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.26 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.44 
 
 		 1263 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1877 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.05 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1037 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 997 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.71 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1493 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.49 
 
 		 838 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.72 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  36.63 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.86 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  31.65 
 
 		 591 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  35.48 
 
 		 202 aa  60.1  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  26.98 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 303 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.32 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  28.23 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 181 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.26 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  29.87 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  29.8 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.01 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.82 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.96 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.35 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.24 
 
 		 2413 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.07 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01554  activator of chitin synthase (Eurofung)  32.1 
 
 		 702 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.158425  normal  0.055064 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.28 
 
 		 599 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  26.38 
 
 		 325 aa  57  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  29.87 
 
 		 221 aa  57  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  30.21 
 
 		 287 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  28.98 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.85 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.58 
 
 		 1260 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.18 
 
 		 679 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32 
 
 		 1059 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>