More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0540 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  98.39 
 
 		 496 aa  1010    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 497 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 497 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  99.4 
 
 		 497 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.71 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.17 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0476  putative periplasmic protein  37.77 
 
 		 503 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  38.09 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0484  hypothetical protein  37.43 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0325737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0539  hypothetical protein  37.43 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  37.11 
 
 		 311 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  37.35 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  37.11 
 
 		 311 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  37.11 
 
 		 301 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  36.72 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.22 
 
 		 831 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1402 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.87 
 
 		 684 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  26.79 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.22 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.79 
 
 		 490 aa  94  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.76 
 
 		 393 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  24.68 
 
 		 961 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.73 
 
 		 789 aa  90.5  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1493 aa  90.1  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.23 
 
 		 341 aa  87  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.6 
 
 		 380 aa  86.7  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  27.21 
 
 		 685 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1032 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.79 
 
 		 552 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1877 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  25.41 
 
 		 557 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.16 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1037 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.97 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.35 
 
 		 2413 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.46 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  39.82 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.84 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.88 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  24.85 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.03 
 
 		 254 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  40.54 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.57 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.94 
 
 		 838 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.11 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  28.16 
 
 		 693 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  36.13 
 
 		 839 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  25.99 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 976 aa  77  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  26.25 
 
 		 985 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.94 
 
 		 731 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  30.92 
 
 		 850 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 1261 aa  73.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  27.89 
 
 		 839 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  38.33 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.5 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 1196 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35 
 
 		 1263 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 1430 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.01 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.1 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  25.23 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1002 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.77 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.46 
 
 		 865 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  36.89 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  34.65 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  25.94 
 
 		 971 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  30.87 
 
 		 1078 aa  70.1  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30.87 
 
 		 1044 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 		 1260 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.41 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.59 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  34.85 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.41 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.94 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.41 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  24 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  24 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  33.81 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.82 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  24 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.26 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  37.37 
 
 		 117 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  23.71 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>