More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0478 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0484  hypothetical protein  94.43 
 
 		 503 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0325737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1044    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0476  putative periplasmic protein  95.83 
 
 		 503 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0539  hypothetical protein  94.43 
 
 		 503 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.13 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.68 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  37.96 
 
 		 497 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  38.09 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  38.09 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  37.95 
 
 		 496 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  37.28 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  36.64 
 
 		 331 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  36.64 
 
 		 311 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  36.15 
 
 		 301 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  36.3 
 
 		 331 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.85 
 
 		 684 aa  104  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.59 
 
 		 961 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1402 aa  94.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.21 
 
 		 393 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.96 
 
 		 831 aa  90.1  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1877 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.3 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1493 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.43 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.88 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.89 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.5 
 
 		 838 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.22 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.61 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.55 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1037 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1002 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.7 
 
 		 208 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.77 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.94 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.73 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.17 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.33 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.93 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1032 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  27.96 
 
 		 839 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.76 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.1 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  25.95 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.24 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  31.74 
 
 		 850 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.22 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  24.74 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.9 
 
 		 1263 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.92 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.89 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.39 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.69 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.1 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  24.27 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 260 aa  67  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1281 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 246 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.58 
 
 		 1260 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  31.41 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  28.3 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.3 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.54 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  37.7 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.29 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.72 
 
 		 278 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1134 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.97 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  33.33 
 
 		 1200 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.25 
 
 		 2413 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.43 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 976 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  23.01 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.43 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  33.33 
 
 		 1200 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  25.17 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  21.57 
 
 		 865 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.88 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.47 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 		 971 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  25.27 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.8 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  24.9 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  25.17 
 
 		 1044 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.61 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  32.79 
 
 		 763 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.18 
 
 		 890 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.17 
 
 		 1078 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  27.88 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.06 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  25.17 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>