56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0957 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  72.98 
 
 		 470 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0957  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 468 aa  945    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  72.98 
 
 		 470 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  71 
 
 		 516 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  69.34 
 
 		 484 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  69.34 
 
 		 477 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  70.6 
 
 		 475 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18520  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  59.32 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119912  normal  0.727737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1602  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  58.86 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  56.26 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  55.9 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  35.94 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.94 
 
 		 321 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  30.94 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.26 
 
 		 684 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.87 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 890 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 		 254 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  29.5 
 
 		 504 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1402 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  28.06 
 
 		 789 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  30.53 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.49 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 		 865 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.09 
 
 		 528 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.34 
 
 		 348 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  29.09 
 
 		 182 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.09 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.37 
 
 		 693 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  31.96 
 
 		 491 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  24.09 
 
 		 831 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  25.6 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  31.75 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  24.42 
 
 		 961 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.5 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.09 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1037 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  39.02 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 997 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 181 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1366 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.75 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.43 
 
 		 255 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  27.06 
 
 		 246 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.97 
 
 		 382 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  36.49 
 
 		 281 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  36.49 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  32.63 
 
 		 285 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  36.49 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.78 
 
 		 523 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 976 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.86 
 
 		 305 aa  43.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>