More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4032 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4032  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 400 aa  789    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.488717 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.03 
 
 		 684 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.21 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.94 
 
 		 831 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.66 
 
 		 961 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1402 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.71 
 
 		 789 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.74 
 
 		 489 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1037 aa  96.3  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.81 
 
 		 557 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.7 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.21 
 
 		 305 aa  93.2  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 425 aa  92.8  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 976 aa  93.2  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.81 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.82 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.39 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.82 
 
 		 464 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  34.01 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  27.31 
 
 		 765 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.07 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.86 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1032 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1493 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.08 
 
 		 890 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.97 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1877 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.13 
 
 		 971 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.22 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  31.88 
 
 		 961 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.13 
 
 		 971 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.12 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  25.29 
 
 		 693 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  26.67 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.44 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.42 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1366 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  31.48 
 
 		 591 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.95 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  29.02 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.74 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.09 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.52 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.85 
 
 		 865 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  24.48 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  28.89 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.33 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 1430 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.94 
 
 		 838 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.67 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  26.19 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.73 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  32.58 
 
 		 505 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  26.94 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  26.94 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.6 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.61 
 
 		 231 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.74 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  36.99 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  31.49 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.16 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  26.07 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.77 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.51 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.07 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  26.53 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.19 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.37 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  26.77 
 
 		 241 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.7 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  23.9 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  26.24 
 
 		 850 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  28.57 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  32.6 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.07 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  26.79 
 
 		 232 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.23 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  24.5 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  25.86 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  35.19 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  25.64 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  25.64 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  27.82 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  28.04 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  32 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  30.98 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  24.62 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.19 
 
 		 1078 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>