176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3068 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  64.04 
 
 		 206 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  63.05 
 
 		 218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  63.05 
 
 		 218 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  63.05 
 
 		 218 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  64.53 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  62.07 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  62.07 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  62.07 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  62.07 
 
 		 218 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  59.61 
 
 		 207 aa  264  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  58.13 
 
 		 227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  63.19 
 
 		 228 aa  256  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  56.57 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  61.41 
 
 		 213 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  56.83 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  47.87 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  48.59 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  42.58 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  42.36 
 
 		 211 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  40.4 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.38 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  40 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.96 
 
 		 679 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  34.02 
 
 		 961 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  31.63 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  31.63 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.91 
 
 		 684 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.09 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1032 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.26 
 
 		 789 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 		 416 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  29.9 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  30.61 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.18 
 
 		 961 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  30.61 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  30.61 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  30.61 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  30.61 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  29.59 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  29.59 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.7 
 
 		 325 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 		 325 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  27.48 
 
 		 491 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  33.7 
 
 		 285 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.81 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.31 
 
 		 890 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  29.59 
 
 		 258 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  27.95 
 
 		 260 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 		 255 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.71 
 
 		 831 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 		 865 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3423  Sel1 domain-containing protein  54.17 
 
 		 502 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.01 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  27.97 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1493 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1402 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  28.45 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  28.87 
 
 		 765 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  37.8 
 
 		 1044 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.86 
 
 		 363 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.09 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  29.81 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.61 
 
 		 327 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  37.8 
 
 		 1078 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1731  Sel1  24.84 
 
 		 499 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0329256  normal  0.626848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.84 
 
 		 393 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.89 
 
 		 838 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1002 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2247  Sel1-like protein  29 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0312034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 		 318 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.71 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.21 
 
 		 489 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 1430 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  29.63 
 
 		 850 aa  48.5  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.5 
 
 		 509 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.17 
 
 		 971 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 1012 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.5 
 
 		 509 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.5 
 
 		 509 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.5 
 
 		 509 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 971 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.87 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1550  hypothetical protein  24.81 
 
 		 431 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.246601  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.4 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  27.61 
 
 		 366 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.43 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  25 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 117 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>