More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2899 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  100 
 
 
442 aa  915    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  64.52 
 
 
428 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.64 
 
 
464 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
696 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 
898 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.07 
 
 
697 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.94 
 
 
1686 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
890 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
900 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.66 
 
 
903 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 
871 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
658 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  39.45 
 
 
1585 aa  88.2  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  47.78 
 
 
151 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.34 
 
 
261 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 
830 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  44.09 
 
 
821 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  38.71 
 
 
762 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.91 
 
 
1760 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  49.44 
 
 
1402 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  44.21 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 
795 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 
795 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  47.31 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  43.01 
 
 
1156 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
1343 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  46.74 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.72 
 
 
469 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
1196 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 
729 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0988  ankyrin  42.7 
 
 
157 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0503606 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  43.62 
 
 
544 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  35.37 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.56 
 
 
1711 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  41.67 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.63 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  38.37 
 
 
723 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.04 
 
 
2413 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  44.19 
 
 
135 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  37.88 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  40 
 
 
1249 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  38.71 
 
 
138 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  38.94 
 
 
2171 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  39.42 
 
 
954 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.07 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.2 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  38.04 
 
 
731 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  33.7 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  46.24 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37212  predicted protein  43.53 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 
1687 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  44.09 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.88 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  42.86 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  34.21 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2208  Ankyrin  34.75 
 
 
144 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00294118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  41.84 
 
 
756 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  38.71 
 
 
870 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.2 
 
 
1004 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  41.94 
 
 
217 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  42.39 
 
 
140 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.04 
 
 
161 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  36.84 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  32.48 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 
841 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  39.68 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  34.69 
 
 
1005 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  38.3 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2472  hypothetical protein  43.96 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  41.57 
 
 
1101 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  26.36 
 
 
1061 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  30.14 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  26.62 
 
 
1619 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 
843 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  41.94 
 
 
474 aa  67  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  38.3 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  40.45 
 
 
1099 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.1 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  37.23 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  41.05 
 
 
1021 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0005  Ankyrin  35.71 
 
 
110 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0136413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 
1088 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3227  ankyrin  40.51 
 
 
111 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621812  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  38.54 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  40.43 
 
 
293 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  40.86 
 
 
891 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  38.04 
 
 
149 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  41.49 
 
 
214 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  38.04 
 
 
149 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0636  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  42.05 
 
 
152 aa  64.3  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  40.66 
 
 
140 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  37.89 
 
 
175 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  41.94 
 
 
227 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.6 
 
 
1274 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  36.11 
 
 
196 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  34.68 
 
 
191 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  35.79 
 
 
483 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  40.43 
 
 
855 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  39.36 
 
 
483 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>