More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3569 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  100 
 
 
227 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  67.74 
 
 
224 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  66.36 
 
 
237 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  72.78 
 
 
214 aa  261  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  67.16 
 
 
233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  60.66 
 
 
217 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  61.5 
 
 
210 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  65.1 
 
 
210 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  57.56 
 
 
254 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  49.53 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  46.3 
 
 
226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  45.25 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  50.79 
 
 
196 aa  204  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  49.74 
 
 
196 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  50.26 
 
 
196 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  50.26 
 
 
196 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  49.21 
 
 
196 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  52.33 
 
 
266 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  58.19 
 
 
285 aa  194  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  46.12 
 
 
221 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  53.03 
 
 
224 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  52.31 
 
 
269 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  45.18 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  46.46 
 
 
264 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  46.46 
 
 
264 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  41.12 
 
 
290 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  46.19 
 
 
261 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  56.94 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  42.13 
 
 
277 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  40.91 
 
 
255 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  41.12 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  41.62 
 
 
289 aa  164  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  40.61 
 
 
290 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  40.91 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  40.91 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  41.12 
 
 
207 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  41.12 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  54.19 
 
 
176 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  50 
 
 
173 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  45.98 
 
 
455 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  40.82 
 
 
201 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  39.29 
 
 
201 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  40.82 
 
 
201 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  40.31 
 
 
201 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  40.31 
 
 
201 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  40.31 
 
 
201 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  40.31 
 
 
201 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  40.31 
 
 
201 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  40.31 
 
 
201 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  36.41 
 
 
210 aa  131  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  36.49 
 
 
1156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  44.62 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  43.52 
 
 
238 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  41.97 
 
 
232 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.75 
 
 
1585 aa  111  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.63 
 
 
426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 
1030 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.82 
 
 
2171 aa  105  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  37 
 
 
305 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.9 
 
 
2413 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.19 
 
 
1402 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  36.46 
 
 
756 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  34.74 
 
 
954 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  36.6 
 
 
762 aa  99.4  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  29.63 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  34.08 
 
 
427 aa  99.4  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  32.08 
 
 
1249 aa  97.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.19 
 
 
321 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  33.54 
 
 
382 aa  95.5  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  34.55 
 
 
494 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  32.55 
 
 
490 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  36.45 
 
 
337 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  33.86 
 
 
1061 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  32.99 
 
 
329 aa  93.6  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  32.64 
 
 
450 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  36.84 
 
 
220 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  30.41 
 
 
249 aa  92.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  35.54 
 
 
541 aa  92.4  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  41.13 
 
 
157 aa  92.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.95 
 
 
870 aa  92  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
469 aa  91.7  8e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  36.99 
 
 
274 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  33.33 
 
 
483 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.24 
 
 
404 aa  88.2  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  36 
 
 
821 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  33.18 
 
 
293 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  37.36 
 
 
423 aa  87  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  34.72 
 
 
346 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.7 
 
 
731 aa  85.9  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  32.22 
 
 
542 aa  85.9  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  36.72 
 
 
144 aa  85.5  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  31.09 
 
 
472 aa  85.1  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  29.78 
 
 
723 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  34.44 
 
 
474 aa  84  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  28.92 
 
 
479 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  32.45 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  36.79 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  30.41 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  30.94 
 
 
646 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  30.41 
 
 
574 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>