117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6053 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
843 aa  1712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  90.9 
 
 
841 aa  1573    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.54 
 
 
474 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2370  putative exported protease/peptidase  50 
 
 
208 aa  165  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0426298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.95 
 
 
552 aa  160  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.39 
 
 
491 aa  160  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  35.61 
 
 
660 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  37.22 
 
 
268 aa  144  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  36.15 
 
 
538 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  36 
 
 
262 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  32.43 
 
 
548 aa  123  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.32 
 
 
275 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  29.47 
 
 
543 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.19 
 
 
494 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  32.95 
 
 
249 aa  121  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  35.51 
 
 
702 aa  117  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.29 
 
 
261 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.2 
 
 
275 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.46 
 
 
243 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.22 
 
 
259 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  36.13 
 
 
209 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  31.65 
 
 
403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.08 
 
 
650 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.06 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  32.95 
 
 
443 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.58 
 
 
307 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.21 
 
 
270 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.6 
 
 
247 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.93 
 
 
249 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.13 
 
 
554 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  29.96 
 
 
582 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.31 
 
 
297 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.89 
 
 
272 aa  101  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  27.27 
 
 
607 aa  97.8  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.46 
 
 
288 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  31.34 
 
 
508 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.34 
 
 
338 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 
432 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  28.46 
 
 
399 aa  93.6  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  29.3 
 
 
558 aa  92.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  27.72 
 
 
333 aa  92  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  31.92 
 
 
278 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  27.18 
 
 
379 aa  87.4  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.15 
 
 
277 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.41 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.27 
 
 
271 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  33.48 
 
 
298 aa  80.9  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.2 
 
 
440 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45961  predicted protein  30.29 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  24.61 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.3 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.24 
 
 
519 aa  73.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004369  secreted trypsin-like serine protease  27.27 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
234 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
717 aa  68.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4945  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 
514 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.88 
 
 
442 aa  67  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0521  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.51 
 
 
542 aa  65.1  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.27 
 
 
255 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.58 
 
 
255 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.75 
 
 
615 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.97 
 
 
250 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
428 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  25.45 
 
 
330 aa  62.4  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.85 
 
 
253 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 
805 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  27.37 
 
 
713 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.75 
 
 
615 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  27.27 
 
 
273 aa  61.6  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
711 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
711 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.68 
 
 
789 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.45 
 
 
309 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1113  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.22 
 
 
265 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_7679  predicted protein  36 
 
 
105 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.15 
 
 
253 aa  57.8  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 
900 aa  57.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
464 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
871 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  28.22 
 
 
255 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 
890 aa  55.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.86 
 
 
633 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 
654 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  26.24 
 
 
903 aa  55.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.85 
 
 
257 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.63 
 
 
469 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 
898 aa  54.3  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  28.85 
 
 
412 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  27.92 
 
 
463 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
457 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  25.5 
 
 
438 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.62 
 
 
1343 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  28.4 
 
 
293 aa  51.6  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  25.64 
 
 
287 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.14 
 
 
301 aa  49.3  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2687  conserved repeat domain protein  29.46 
 
 
541 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000153291  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  27.27 
 
 
311 aa  48.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 
907 aa  47.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.07 
 
 
719 aa  47.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>