87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3211 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.53 
 
 
254 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.51 
 
 
271 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.34 
 
 
277 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  40.54 
 
 
392 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  37.12 
 
 
273 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.87 
 
 
300 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  36.84 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4945  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.44 
 
 
514 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5875  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31 
 
 
264 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00114618  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.54 
 
 
474 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.7 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.84 
 
 
519 aa  95.9  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  30.42 
 
 
660 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.69 
 
 
552 aa  92.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0521  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.11 
 
 
542 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.96 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  32.92 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.76 
 
 
841 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  31.17 
 
 
399 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  32.13 
 
 
443 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.38 
 
 
432 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.31 
 
 
494 aa  85.9  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  30.69 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.12 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.41 
 
 
843 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  30.2 
 
 
538 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  29.79 
 
 
702 aa  82.8  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.31 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  28.46 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.85 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.65 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.92 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  29.44 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.76 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.51 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  25.5 
 
 
379 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.05 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  28.41 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.46 
 
 
554 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.71 
 
 
650 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.23 
 
 
440 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  28.57 
 
 
548 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  27.34 
 
 
403 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  27.9 
 
 
508 aa  63.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004369  secreted trypsin-like serine protease  26.87 
 
 
388 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.59 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.27 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.91 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  27.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  28.39 
 
 
298 aa  55.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.16 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.62 
 
 
467 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.21 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.47 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.24 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.76 
 
 
290 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45961  predicted protein  24 
 
 
366 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0055  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 
416 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.9 
 
 
338 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.89 
 
 
259 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 
290 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  25.49 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.38 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3741  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.66 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  26.05 
 
 
558 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1830  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.61 
 
 
465 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  25.1 
 
 
582 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.43 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1271  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.77 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.356489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.63 
 
 
274 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.44 
 
 
255 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.61 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  24.6 
 
 
323 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3480  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.57 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.92 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.8152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>