93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1658 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
615 aa  1275    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  98.86 
 
 
615 aa  1263    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  29.28 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.33 
 
 
270 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
276 aa  104  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  26.79 
 
 
378 aa  98.6  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 
278 aa  98.2  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 
298 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 
275 aa  97.1  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.99 
 
 
979 aa  95.5  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.02 
 
 
285 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.16 
 
 
275 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  25.89 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  32.79 
 
 
322 aa  83.2  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.67 
 
 
907 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.57 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.6 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  26.06 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  28.27 
 
 
438 aa  77  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.14 
 
 
666 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
850 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
1316 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  26.17 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  36.25 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 
612 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  34.81 
 
 
404 aa  72  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  37.17 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
789 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 
654 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 
633 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 
841 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 
324 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.75 
 
 
843 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.82 
 
 
641 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.84 
 
 
711 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.84 
 
 
711 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  27.57 
 
 
292 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.43 
 
 
719 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 
900 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.22 
 
 
265 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
464 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 
805 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.72 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  30.32 
 
 
369 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
288 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 
538 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 
717 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 
316 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  32 
 
 
903 aa  57.4  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1343 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
538 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  25.59 
 
 
609 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.92 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  25.44 
 
 
277 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 
431 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
648 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
428 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 
612 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  29.73 
 
 
328 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.39 
 
 
302 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
871 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  25.81 
 
 
509 aa  53.9  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 
898 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 
1106 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  24 
 
 
1160 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
562 aa  51.2  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  26.45 
 
 
509 aa  50.8  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  27.22 
 
 
297 aa  50.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
499 aa  50.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.59 
 
 
397 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.36 
 
 
343 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  24.83 
 
 
633 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  30.41 
 
 
205 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  29.73 
 
 
325 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  27.81 
 
 
587 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 
1731 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.14 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.8 
 
 
2050 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  28.93 
 
 
500 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93753  predicted protein  34.95 
 
 
495 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 
1687 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
355 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 
590 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  22.84 
 
 
510 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 
502 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.75 
 
 
522 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  34.23 
 
 
671 aa  43.9  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.14 
 
 
1554 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 
890 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.03 
 
 
325 aa  43.5  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>