34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5582 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 641 aa  1267    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.03 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 850 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  30 
 
 		 540 aa  98.2  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.1 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.82 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.84 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.38 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 		 907 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.82 
 
 		 491 aa  53.9  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  33.33 
 
 		 205 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  30.28 
 
 		 633 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 		 464 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 		 278 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  23.17 
 
 		 293 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  27.5 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 		 979 aa  48.5  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.41 
 
 		 428 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 590 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 890 aa  47.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  28.21 
 
 		 322 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 871 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.6 
 
 		 1731 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.41 
 
 		 1106 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.69 
 
 		 265 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  32.71 
 
 		 442 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.5 
 
 		 1316 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 431 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>