262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0868 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1106 aa  2205    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 		 1088 aa  251  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0890  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 		 591 aa  177  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0212569  normal  0.465955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1510 aa  102  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 830 aa  93.2  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 		 1481 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.29 
 
 		 919 aa  91.3  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 		 941 aa  88.2  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.48 
 
 		 1656 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 902 aa  85.5  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  27.42 
 
 		 1160 aa  84.7  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  26.09 
 
 		 1619 aa  84.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  34.33 
 
 		 696 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  34.95 
 
 		 840 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1553 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.37 
 
 		 1363 aa  82  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1097 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.43 
 
 		 1523 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.36 
 
 		 1364 aa  78.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  33.65 
 
 		 947 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.56 
 
 		 1557 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1211 aa  77  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.06 
 
 		 1247 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 		 1240 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.72 
 
 		 740 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1196 aa  74.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.87 
 
 		 1330 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.58 
 
 		 1760 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.56 
 
 		 1454 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.36 
 
 		 676 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  37.62 
 
 		 1214 aa  73.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.21 
 
 		 698 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1789 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.54 
 
 		 1686 aa  71.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.34 
 
 		 1164 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  30.88 
 
 		 344 aa  70.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.72 
 
 		 657 aa  71.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 		 1236 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  31.07 
 
 		 346 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.08 
 
 		 1652 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.05 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32 
 
 		 1161 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 1221 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32 
 
 		 1161 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1367 aa  68.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1474 aa  68.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.07 
 
 		 1807 aa  67.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.23 
 
 		 464 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.73 
 
 		 1711 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1190 aa  67.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.39 
 
 		 1599 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.2 
 
 		 1357 aa  66.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  30.88 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.92 
 
 		 1831 aa  65.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.27 
 
 		 1443 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.92 
 
 		 1242 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.26 
 
 		 1609 aa  65.1  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.03 
 
 		 1217 aa  64.7  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1552 aa  64.7  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 		 1016 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 		 1016 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.05 
 
 		 930 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 729 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.54 
 
 		 1901 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 687 aa  63.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 		 954 aa  63.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.5 
 
 		 1188 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  33.04 
 
 		 1344 aa  62.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1599 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 		 1348 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.53 
 
 		 1607 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.14 
 
 		 1623 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  32.14 
 
 		 477 aa  62  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.44 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  33.65 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.94 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.88 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.34 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.99 
 
 		 564 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1229 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.46 
 
 		 924 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.11 
 
 		 1039 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.85 
 
 		 1583 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.36 
 
 		 1213 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  31.53 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.48 
 
 		 1267 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.55 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.43 
 
 		 1188 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>