More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0196 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 
840 aa  1607    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.69 
 
 
947 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  35.28 
 
 
1196 aa  202  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  41.72 
 
 
696 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.39 
 
 
1163 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.82 
 
 
1364 aa  194  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.23 
 
 
1557 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.28 
 
 
1363 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.13 
 
 
1652 aa  190  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.62 
 
 
1236 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.21 
 
 
676 aa  181  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.41 
 
 
740 aa  178  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  35.31 
 
 
344 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31.75 
 
 
1789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.95 
 
 
1188 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  38.4 
 
 
742 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  34.75 
 
 
344 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  33.77 
 
 
1523 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.83 
 
 
1553 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  36.73 
 
 
1357 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  39.65 
 
 
1211 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  33.02 
 
 
1552 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.39 
 
 
1247 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.53 
 
 
1481 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.32 
 
 
677 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.77 
 
 
1221 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.86 
 
 
1686 aa  170  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 
1807 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 
1213 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.57 
 
 
919 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.06 
 
 
1240 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.9 
 
 
1193 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.73 
 
 
1217 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 
464 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  34.19 
 
 
434 aa  162  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
1831 aa  160  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  33.22 
 
 
1367 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.6 
 
 
1190 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.06 
 
 
1510 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.14 
 
 
1599 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.3 
 
 
1901 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.22 
 
 
1547 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  35.2 
 
 
1242 aa  157  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 
1878 aa  157  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.11 
 
 
675 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.95 
 
 
1454 aa  157  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.81 
 
 
1607 aa  157  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31 
 
 
1262 aa  157  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.33 
 
 
1267 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.72 
 
 
930 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.67 
 
 
630 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  37.07 
 
 
540 aa  154  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  41.31 
 
 
790 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.65 
 
 
1598 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.08 
 
 
682 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 
1623 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 
1474 aa  153  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31 
 
 
576 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.21 
 
 
1711 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.79 
 
 
1626 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.19 
 
 
657 aa  151  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.17 
 
 
737 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.88 
 
 
1868 aa  151  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.8 
 
 
664 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.39 
 
 
1617 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  29.03 
 
 
564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 
1760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.12 
 
 
692 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.51 
 
 
642 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.55 
 
 
589 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.62 
 
 
505 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  32.87 
 
 
1177 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.97 
 
 
1229 aa  147  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.08 
 
 
1609 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.63 
 
 
1416 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.79 
 
 
443 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.09 
 
 
1583 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
687 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
1188 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 
1443 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.19 
 
 
924 aa  144  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  29.87 
 
 
317 aa  144  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.84 
 
 
1411 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.09 
 
 
1398 aa  144  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  34.47 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  33.12 
 
 
1280 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  33.22 
 
 
608 aa  142  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  36.44 
 
 
1661 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  33.06 
 
 
1858 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.04 
 
 
1656 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  37.55 
 
 
1214 aa  140  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.69 
 
 
596 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.21 
 
 
842 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  37.15 
 
 
335 aa  140  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.83 
 
 
1599 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.82 
 
 
1348 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 
1164 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  31.42 
 
 
504 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.85 
 
 
1714 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.6 
 
 
1209 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>