More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3477 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
830 aa  1716    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.4 
 
 
1097 aa  272  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 
941 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 
902 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
1088 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  26.7 
 
 
1619 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 
1363 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 
1236 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.71 
 
 
1901 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.32 
 
 
1807 aa  101  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.55 
 
 
1652 aa  98.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.75 
 
 
1188 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 
1106 aa  98.2  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.32 
 
 
677 aa  98.2  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.79 
 
 
1163 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
658 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.41 
 
 
1162 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.14 
 
 
1196 aa  95.1  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.87 
 
 
1221 aa  94.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.9 
 
 
1208 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 
342 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 
947 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 
1343 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.3 
 
 
1364 aa  92  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.24 
 
 
464 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.39 
 
 
1474 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.44 
 
 
1217 aa  90.9  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.22 
 
 
696 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
1686 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.48 
 
 
346 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.2 
 
 
1454 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.07 
 
 
692 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.71 
 
 
930 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  24.8 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.87 
 
 
740 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 
1760 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.24 
 
 
1552 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 
698 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.18 
 
 
1711 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 
428 aa  84  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  20.48 
 
 
1523 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  20.92 
 
 
1416 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.24 
 
 
1831 aa  82  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.38 
 
 
443 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.32 
 
 
1247 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.35 
 
 
1443 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 
1766 aa  81.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 
1411 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  27.82 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  18.9 
 
 
1160 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.87 
 
 
576 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.83 
 
 
1348 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
309 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 
1481 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 
344 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  20.62 
 
 
1193 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.49 
 
 
1262 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.83 
 
 
1188 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.49 
 
 
642 aa  79.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.98 
 
 
1214 aa  78.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.2 
 
 
1213 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 
1211 aa  77.8  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.87 
 
 
1599 aa  77.8  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.7 
 
 
1510 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.23 
 
 
1609 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.28 
 
 
664 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  19.35 
 
 
1868 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.94 
 
 
1557 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.19 
 
 
676 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.8 
 
 
1553 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.83 
 
 
742 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.75 
 
 
682 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
871 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.65 
 
 
1190 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  21.24 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.42 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  21.81 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.11 
 
 
733 aa  74.7  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  24.08 
 
 
1334 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.15 
 
 
1477 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 
795 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  24.37 
 
 
774 aa  73.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  20.9 
 
 
1280 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.41 
 
 
1823 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 
1190 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.1 
 
 
596 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.75 
 
 
795 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.86 
 
 
1161 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.79 
 
 
1161 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 
344 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.71 
 
 
1547 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3199  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304748  normal  0.316415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  21.62 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  22.51 
 
 
762 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.38 
 
 
505 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  18.83 
 
 
657 aa  72  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.43 
 
 
636 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.24 
 
 
608 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.71 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>