69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6572 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1162 aa  2343    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1097 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 		 830 aa  105  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 		 941 aa  92.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.16 
 
 		 902 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 890 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 871 aa  66.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1807 aa  65.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 898 aa  64.7  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08293  snoRNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04310)  31.34 
 
 		 938 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0710686  hitchhiker  0.0000000000000896141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 654 aa  62  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.67 
 
 		 1523 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.84 
 
 		 1454 aa  60.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.3 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.3 
 
 		 1088 aa  59.3  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  25 
 
 		 442 aa  57.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.47 
 
 		 466 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 		 261 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 1686 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  26.89 
 
 		 781 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.33 
 
 		 903 aa  56.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 		 428 aa  55.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 		 658 aa  55.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 1760 aa  55.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.75 
 
 		 1831 aa  55.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.3 
 
 		 464 aa  54.7  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1399 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.27 
 
 		 740 aa  53.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.99 
 
 		 1901 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1474 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 		 1193 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.29 
 
 		 1262 aa  50.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 		 1004 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  31.41 
 
 		 1427 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.87 
 
 		 1229 aa  50.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.56 
 
 		 1711 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 		 1106 aa  49.3  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.54 
 
 		 729 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 636 aa  49.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.59 
 
 		 947 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.39 
 
 		 1481 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  21 
 
 		 1160 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.14 
 
 		 344 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  25.73 
 
 		 587 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.74 
 
 		 344 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 		 578 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 		 578 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.83 
 
 		 561 aa  46.6  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 		 579 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 1004 aa  47.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.41 
 
 		 1039 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.43 
 
 		 1163 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.49 
 
 		 677 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 		 491 aa  45.8  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  25.25 
 
 		 371 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1553 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 397 aa  45.8  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  32.41 
 
 		 1041 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  25.1 
 
 		 509 aa  45.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 278 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 		 366 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  25.13 
 
 		 439 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.07 
 
 		 792 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  22.87 
 
 		 389 aa  45.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.07 
 
 		 696 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  22.68 
 
 		 782 aa  45.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  27.1 
 
 		 331 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.43 
 
 		 1357 aa  45.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>