52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2371 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 561 aa  1120    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.97 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.62 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0281  hypothetical protein  38.16 
 
 		 280 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 		 1316 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.82 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  30.41 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  29.87 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.92 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.41 
 
 		 1088 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  24.73 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  23.44 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 		 633 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 898 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.95 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 		 658 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.2 
 
 		 302 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 900 aa  54.3  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 		 1196 aa  54.3  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  31.25 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.9 
 
 		 903 aa  52.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 590 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  25.68 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  25 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  28.03 
 
 		 277 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 		 261 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 871 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 890 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 275 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  31.29 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 		 729 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 		 343 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.04 
 
 		 979 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 717 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  22.55 
 
 		 509 aa  47.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.82 
 
 		 612 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  30.82 
 
 		 609 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 		 502 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  28.68 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  24.69 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.02 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 		 497 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1097 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.28 
 
 		 288 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  28.08 
 
 		 297 aa  44.3  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  25.5 
 
 		 463 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.9 
 
 		 578 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>