56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2725 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  48.91 
 
 
276 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.48 
 
 
275 aa  249  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.28 
 
 
270 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.36 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.02 
 
 
278 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  31.88 
 
 
293 aa  133  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.72 
 
 
979 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.82 
 
 
907 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.89 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.16 
 
 
615 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 
615 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 
633 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  29.92 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  28.09 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  26.76 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  29.27 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  28.2 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  31.01 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  27.61 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.43 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.39 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.95 
 
 
612 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.06 
 
 
612 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  29.06 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  26.09 
 
 
438 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.09 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.02 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
654 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.24 
 
 
717 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
898 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  27.81 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.95 
 
 
648 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  28.93 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.1 
 
 
789 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  30.13 
 
 
369 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 
890 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  29.2 
 
 
517 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 
805 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  28.38 
 
 
1619 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.82 
 
 
464 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
428 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 
671 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 
561 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 
900 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33 
 
 
719 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 
278 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  22.98 
 
 
903 aa  45.8  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 
711 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
871 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 
711 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 
666 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>