45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0716 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.82 
 
 		 343 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  50.5 
 
 		 297 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.17 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.58 
 
 		 562 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.03 
 
 		 612 aa  224  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.9 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.45 
 
 		 612 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  39.45 
 
 		 609 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.67 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  28.24 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 		 979 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 		 907 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  27.73 
 
 		 378 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.29 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.47 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  34.64 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  26.98 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  32.18 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  26.84 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.42 
 
 		 1316 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.54 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  33.33 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 		 633 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  34.42 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 		 615 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  25.97 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  30.36 
 
 		 463 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.68 
 
 		 538 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 538 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  34.31 
 
 		 517 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 561 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.83 
 
 		 850 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.54 
 
 		 654 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.07 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  31.67 
 
 		 633 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 		 648 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>