41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3436 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 654 aa  1344    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 		 491 aa  88.2  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.34 
 
 		 633 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 		 907 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  26.79 
 
 		 292 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 275 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  24.34 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.44 
 
 		 850 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.33 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  28.75 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.64 
 
 		 843 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  23.51 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.22 
 
 		 979 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 		 717 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.18 
 
 		 275 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 288 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 309 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 		 562 aa  51.6  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  51.2  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.74 
 
 		 285 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 		 1316 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  26.54 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 302 aa  47.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.58 
 
 		 343 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.32 
 
 		 648 aa  47.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24 
 
 		 612 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  24 
 
 		 609 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  25.88 
 
 		 378 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.38 
 
 		 798 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>