68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1193 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 275 aa  577  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  65.19 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  63.06 
 
 		 276 aa  362  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.16 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.48 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  35.37 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 979 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  31.49 
 
 		 403 aa  113  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.18 
 
 		 907 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 		 615 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.33 
 
 		 615 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  31.76 
 
 		 378 aa  96.3  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 		 633 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  29.18 
 
 		 438 aa  89.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  30.39 
 
 		 463 aa  88.6  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  38.24 
 
 		 517 aa  86.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  30.47 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.55 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  33.53 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.63 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.57 
 
 		 612 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  33.12 
 
 		 420 aa  72  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 		 717 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  29.51 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 		 1316 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.31 
 
 		 805 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.52 
 
 		 666 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  28.74 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.73 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  34.19 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.9 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.9 
 
 		 442 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 900 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.67 
 
 		 711 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.67 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.7 
 
 		 719 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  31.85 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  29.73 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 890 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 464 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.18 
 
 		 654 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.14 
 
 		 903 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 898 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.79 
 
 		 658 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  32.99 
 
 		 671 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 538 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 		 590 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 		 850 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.89 
 
 		 431 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 		 841 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.67 
 
 		 538 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.71 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 871 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  36.36 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1274 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 1554 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>