45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00130 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  100 
 
 
517 aa  1070    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  67.16 
 
 
463 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  53.79 
 
 
403 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  40.56 
 
 
378 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  46.43 
 
 
438 aa  163  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  56.3 
 
 
420 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  43.33 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  37.06 
 
 
292 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  45.31 
 
 
369 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  43.08 
 
 
404 aa  90.9  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.48 
 
 
278 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  39.23 
 
 
293 aa  87.4  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
276 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.24 
 
 
275 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.4 
 
 
979 aa  83.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.82 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.56 
 
 
270 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  36.09 
 
 
633 aa  73.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.37 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.17 
 
 
615 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.29 
 
 
612 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.78 
 
 
717 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.49 
 
 
285 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 
805 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.95 
 
 
789 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 
719 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 
562 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.86 
 
 
907 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.53 
 
 
711 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.53 
 
 
711 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93753  predicted protein  29.73 
 
 
495 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 
1316 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.22 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 
275 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  34.31 
 
 
277 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
561 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  31.58 
 
 
297 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42 
 
 
265 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 
633 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
590 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 
666 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  32.58 
 
 
671 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.96 
 
 
841 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>