109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2384 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 590 aa  1212    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.04 
 
 		 477 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 871 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  34.53 
 
 		 903 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 900 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 890 aa  123  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 		 898 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 		 658 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 1088 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  34.38 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  33.87 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  32.64 
 
 		 163 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  34.53 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 1106 aa  62.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.87 
 
 		 1343 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  31.58 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  35.56 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.49 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.07 
 
 		 1760 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  25.97 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.24 
 
 		 830 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.39 
 
 		 2002 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 729 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  31.97 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.52 
 
 		 491 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 		 1316 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.03 
 
 		 1711 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  36.78 
 
 		 731 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.73 
 
 		 795 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 		 499 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.73 
 
 		 795 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  27.27 
 
 		 540 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  22.98 
 
 		 442 aa  53.9  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 		 278 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  32.22 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 		 497 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.36 
 
 		 1686 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  26.88 
 
 		 500 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 561 aa  51.6  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.57 
 
 		 841 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.82 
 
 		 278 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  30.41 
 
 		 670 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 		 265 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  27.97 
 
 		 420 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 301 aa  50.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.91 
 
 		 717 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1097 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  29.45 
 
 		 636 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 		 1481 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 805 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1687 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  26.8 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  30 
 
 		 517 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1022 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.23 
 
 		 502 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  25.32 
 
 		 181 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 		 654 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  26 
 
 		 328 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  29.01 
 
 		 781 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.94 
 
 		 746 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  26.17 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 641 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.05 
 
 		 1004 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 		 696 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  28.78 
 
 		 331 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 		 316 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.67 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 576 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.75 
 
 		 843 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  26.11 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 		 324 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.54 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  29.82 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 719 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  23.24 
 
 		 1619 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  24.83 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 		 1731 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 697 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 1672 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  23.03 
 
 		 509 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.41 
 
 		 587 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  28.74 
 
 		 245 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  29.53 
 
 		 322 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  32.91 
 
 		 671 aa  44.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 578 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 		 615 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 578 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>