30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3265 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  36.93 
 
 
181 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  35.11 
 
 
176 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  32.34 
 
 
165 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.21 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  34.32 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  30.73 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  32.43 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  31.1 
 
 
190 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  30.72 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  27.73 
 
 
2002 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  31.19 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  38.16 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  26.16 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  25.67 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  36.21 
 
 
317 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.67 
 
 
1035 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  27.69 
 
 
337 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  32.76 
 
 
1123 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  24.16 
 
 
1022 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  34.67 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  30.25 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  29.2 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  32.17 
 
 
1152 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 
590 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  32.2 
 
 
591 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  26.83 
 
 
587 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  28.38 
 
 
316 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  27.16 
 
 
190 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>