28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0436 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  43.39 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  42.28 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  38.94 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.87 
 
 		 2002 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  43.65 
 
 		 670 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.2 
 
 		 746 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.38 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  38.06 
 
 		 514 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  32.35 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  30.9 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  33.1 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  28.36 
 
 		 163 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  31.58 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  31.79 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1022 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 		 463 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  32.89 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.57 
 
 		 1035 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  23.93 
 
 		 587 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2070  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  41.67 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  29.2 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1123 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  29.36 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  23.31 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  29.93 
 
 		 176 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>