23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1185 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1123 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  34.86 
 
 		 571 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1152 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  35.32 
 
 		 591 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.32 
 
 		 746 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  36.81 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  30.99 
 
 		 477 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  30.92 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  34.26 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  31.11 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  37.21 
 
 		 166 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  32.89 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  34.25 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  35 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  38.27 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  29.2 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  30.86 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  32.1 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  28.4 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>