More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0807 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1219    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  45.83 
 
 		 1152 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.55 
 
 		 826 aa  87  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.04 
 
 		 1362 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1406 aa  84  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 726 aa  84  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  37.59 
 
 		 1989 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  48.15 
 
 		 859 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  42.74 
 
 		 1120 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  46.08 
 
 		 1387 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  35.59 
 
 		 3921 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  35.95 
 
 		 1029 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.02 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 2554 aa  77  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  32.82 
 
 		 2573 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.82 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  44.44 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.32 
 
 		 1682 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 3295 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  44.44 
 
 		 669 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1282 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  39.67 
 
 		 1842 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.55 
 
 		 791 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  44.79 
 
 		 1667 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  46.43 
 
 		 978 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.12 
 
 		 1200 aa  76.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  50 
 
 		 1231 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  42.42 
 
 		 1528 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  39.81 
 
 		 1300 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40 
 
 		 1882 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.25 
 
 		 2122 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.35 
 
 		 979 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.56 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.41 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.73 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.9 
 
 		 2272 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  40 
 
 		 2036 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.19 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1022 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  37.61 
 
 		 1293 aa  73.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  47.25 
 
 		 941 aa  73.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  47.5 
 
 		 658 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  38.05 
 
 		 581 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.95 
 
 		 1969 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  50 
 
 		 940 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  47.5 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.91 
 
 		 752 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  37.17 
 
 		 713 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  47.5 
 
 		 184 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  50 
 
 		 2000 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.04 
 
 		 1132 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  46.51 
 
 		 1356 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.51 
 
 		 930 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.05 
 
 		 915 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  25.68 
 
 		 2002 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  44.58 
 
 		 1241 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39.6 
 
 		 1094 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  33.79 
 
 		 1830 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.27 
 
 		 3191 aa  70.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  48.1 
 
 		 963 aa  70.5  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.53 
 
 		 910 aa  70.5  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  47.22 
 
 		 1236 aa  70.5  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  44.44 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  40.59 
 
 		 1732 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.03 
 
 		 840 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.46 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  47.56 
 
 		 1414 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.12 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  43.9 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  43.18 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  47.5 
 
 		 819 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  38.71 
 
 		 703 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  41.24 
 
 		 778 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  44.83 
 
 		 848 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  43.48 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.66 
 
 		 1361 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.18 
 
 		 845 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1066 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  43.84 
 
 		 816 aa  67  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.3 
 
 		 1862 aa  67.4  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  47.3 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  51.61 
 
 		 1042 aa  67  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.71 
 
 		 786 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  44.58 
 
 		 929 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.42 
 
 		 958 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  40.45 
 
 		 869 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.21 
 
 		 823 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  32.56 
 
 		 1750 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  40.86 
 
 		 1275 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1667 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  44.58 
 
 		 2065 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  42.48 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.24 
 
 		 777 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  49.32 
 
 		 1001 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.74 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  39.8 
 
 		 1123 aa  65.1  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2607  PKD  55 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  45.33 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>