35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3267 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  100 
 
 
1123 aa  2328    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  46.44 
 
 
591 aa  177  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  42.68 
 
 
571 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  35.31 
 
 
295 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  38 
 
 
1152 aa  124  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  33.33 
 
 
480 aa  107  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  30.84 
 
 
477 aa  93.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  35.8 
 
 
380 aa  90.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  33.33 
 
 
746 aa  88.6  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  42.41 
 
 
317 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  29.25 
 
 
230 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  41.25 
 
 
166 aa  55.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  34.21 
 
 
187 aa  51.6  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  33.02 
 
 
967 aa  50.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  36.59 
 
 
165 aa  50.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.19 
 
 
892 aa  48.9  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  34.83 
 
 
179 aa  48.5  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  33.33 
 
 
840 aa  48.5  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  32.76 
 
 
245 aa  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  27.01 
 
 
181 aa  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  42.67 
 
 
1057 aa  47.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  31.01 
 
 
818 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  30.82 
 
 
823 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.06 
 
 
836 aa  47.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  43.37 
 
 
176 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.63 
 
 
873 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  43.33 
 
 
938 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  43.08 
 
 
660 aa  46.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  32.89 
 
 
316 aa  45.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  29.34 
 
 
499 aa  45.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  33.33 
 
 
343 aa  45.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  32.53 
 
 
780 aa  44.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  32.94 
 
 
224 aa  44.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 
918 aa  44.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 
1606 aa  44.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>