34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2076 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 		 317 aa  631  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  36.87 
 
 		 591 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  42.41 
 
 		 1123 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.13 
 
 		 746 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  36.81 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  29.51 
 
 		 571 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  38.12 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.86 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  53.75 
 
 		 166 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  37.93 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1152 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  37.37 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  29.33 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  29.85 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  28.22 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  38.67 
 
 		 187 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.78 
 
 		 1035 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  35.96 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 480 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.67 
 
 		 670 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  35.92 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  36.14 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  24.32 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.37 
 
 		 590 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  31.25 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  35.81 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  34.38 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  33.01 
 
 		 1310 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  28.68 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  29.5 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  29.29 
 
 		 2002 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  29.8 
 
 		 587 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>