105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2914 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 1035 aa  2063    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  41.87 
 
 		 1310 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 514 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  48.72 
 
 		 337 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  45.64 
 
 		 409 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  68.6 
 
 		 2042 aa  99.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  46.1 
 
 		 757 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 4761 aa  94.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  66.67 
 
 		 1672 aa  82  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  47.58 
 
 		 1848 aa  80.9  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  62.79 
 
 		 1673 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  40.54 
 
 		 608 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  35.1 
 
 		 253 aa  77  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.38 
 
 		 859 aa  77  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  28.46 
 
 		 2002 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  31.48 
 
 		 1306 aa  75.5  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  28.88 
 
 		 4357 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0745  hypothetical protein  37.6 
 
 		 146 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  48.91 
 
 		 1736 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  34.55 
 
 		 1303 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1367 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  29.73 
 
 		 471 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 2082 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  29.96 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  37.61 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 1013 aa  64.7  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1735 aa  63.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  56.04 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3234  hypothetical protein  26.27 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.78 
 
 		 670 aa  62.4  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.61 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  29.55 
 
 		 3907 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  29.44 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  34.13 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  53.95 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  31.46 
 
 		 2223 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.83 
 
 		 288 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  40 
 
 		 1193 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  35.96 
 
 		 1695 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  29.41 
 
 		 343 aa  55.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  30.05 
 
 		 333 aa  55.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  28.57 
 
 		 2066 aa  55.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.68 
 
 		 265 aa  55.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.99 
 
 		 1001 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1646  putative lipoprotein  35 
 
 		 341 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  28.5 
 
 		 299 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  35 
 
 		 756 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  29.14 
 
 		 2447 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  27.32 
 
 		 981 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  29.67 
 
 		 245 aa  52.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 		 598 aa  52  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2650  agarase  34.81 
 
 		 787 aa  52.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000351829  normal  0.0319277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.37 
 
 		 12684 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  30.63 
 
 		 595 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  32.73 
 
 		 1428 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  51.6  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.44 
 
 		 864 aa  51.6  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.98 
 
 		 746 aa  51.2  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  30.63 
 
 		 588 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 1112 aa  51.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  27.96 
 
 		 250 aa  50.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  39.78 
 
 		 317 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.67 
 
 		 1072 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  37.18 
 
 		 1073 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25.99 
 
 		 6678 aa  50.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  24.71 
 
 		 258 aa  50.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1265 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  28.5 
 
 		 739 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  24.66 
 
 		 252 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 2886 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  25.85 
 
 		 316 aa  49.7  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  32.43 
 
 		 1424 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  29.23 
 
 		 865 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.04 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.44 
 
 		 846 aa  48.5  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  24.52 
 
 		 250 aa  48.1  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  25.79 
 
 		 1121 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  44.62 
 
 		 1095 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.95 
 
 		 1212 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 		 603 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.6 
 
 		 812 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 1121 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  28.64 
 
 		 739 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  29.33 
 
 		 163 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1076  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  47  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  4.83756e-35 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  26.7 
 
 		 531 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  30.56 
 
 		 663 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 1121 aa  46.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  40.23 
 
 		 835 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  34.83 
 
 		 897 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  26.09 
 
 		 1066 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1504 aa  45.8  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.9 
 
 		 726 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  45.45 
 
 		 14944 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.44 
 
 		 3507 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  27.89 
 
 		 848 aa  45.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3186  hypothetical protein  36.13 
 
 		 255 aa  45.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  34.09 
 
 		 3802 aa  45.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  28.44 
 
 		 586 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>