More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1459 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 603 aa  1231    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.83 
 
 		 598 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.03 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.34 
 
 		 655 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.37 
 
 		 607 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.35 
 
 		 671 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 599 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 		 555 aa  346  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  36.82 
 
 		 615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  36.48 
 
 		 608 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  38.67 
 
 		 555 aa  316  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  25.07 
 
 		 756 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  25.07 
 
 		 756 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  25.07 
 
 		 756 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  31.66 
 
 		 232 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 		 232 aa  94.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 		 224 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.79 
 
 		 268 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  28.72 
 
 		 225 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  28.28 
 
 		 224 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  28.28 
 
 		 224 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  28.8 
 
 		 223 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  28.65 
 
 		 245 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 224 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.62 
 
 		 225 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.6 
 
 		 235 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  44.23 
 
 		 241 aa  88.2  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  29.89 
 
 		 220 aa  88.2  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  32.84 
 
 		 230 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  30.2 
 
 		 262 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  38.19 
 
 		 231 aa  87  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.59 
 
 		 230 aa  87  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  41.23 
 
 		 248 aa  86.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.27 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  31.53 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  41.12 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  27.59 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  31.46 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  27.59 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  31.91 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  30.52 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  26.73 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  27.23 
 
 		 236 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 		 227 aa  82.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  28.89 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  36.92 
 
 		 238 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  36.69 
 
 		 233 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  32.45 
 
 		 225 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  36.69 
 
 		 233 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  31.02 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.18 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  34.27 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.27 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.38 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.9 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  34.97 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  31.68 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  30.48 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  43.16 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  30.26 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  34.97 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  34.97 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  30.26 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  34.97 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  30.26 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  31.91 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1054 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  29.95 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.93 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  33.57 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  33.57 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  30.77 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  30.27 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  29.95 
 
 		 225 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.2 
 
 		 236 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  30.6 
 
 		 233 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 		 224 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.6 
 
 		 233 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.88 
 
 		 223 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  33.8 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  31.16 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  47.44 
 
 		 243 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  34.46 
 
 		 222 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>