72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0396 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  100 
 
 		 1306 aa  2655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  34.43 
 
 		 1072 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  31.86 
 
 		 1255 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1252 aa  248  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  31.86 
 
 		 1248 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  31.08 
 
 		 1261 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  30.81 
 
 		 1258 aa  239  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1553 aa  228  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  31 
 
 		 1532 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  31.5 
 
 		 837 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1463 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1543 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1541 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1543 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  33.47 
 
 		 907 aa  209  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  29.7 
 
 		 1382 aa  208  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1543 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  29.27 
 
 		 1257 aa  197  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1576 aa  195  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  27.71 
 
 		 906 aa  187  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1504 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1085 aa  186  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  27.15 
 
 		 900 aa  170  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1133 aa  169  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  25.79 
 
 		 1537 aa  161  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  27.08 
 
 		 1168 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1508 aa  124  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1202 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.48 
 
 		 1035 aa  75.1  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1544 aa  74.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  27.04 
 
 		 471 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  27.96 
 
 		 1310 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.36 
 
 		 1265 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  21.95 
 
 		 1008 aa  66.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.46 
 
 		 4761 aa  65.1  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.69 
 
 		 6678 aa  65.1  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  26.24 
 
 		 793 aa  64.3  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1367 aa  63.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 1121 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.63 
 
 		 1298 aa  57.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  28.4 
 
 		 3907 aa  56.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  26.24 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  25.54 
 
 		 251 aa  55.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.82 
 
 		 846 aa  55.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1101 aa  52.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.98 
 
 		 11716 aa  52.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.7 
 
 		 288 aa  52  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  25.94 
 
 		 250 aa  52  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  26.27 
 
 		 2447 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.4 
 
 		 1735 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  51.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  22.74 
 
 		 2066 aa  50.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1931 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.42 
 
 		 1424 aa  48.9  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  25.39 
 
 		 258 aa  48.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  26.75 
 
 		 786 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1191 aa  48.5  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  24.66 
 
 		 848 aa  48.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 1471 aa  47.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.85 
 
 		 864 aa  47.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1916 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  47.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.15 
 
 		 1064 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.49 
 
 		 4433 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.32 
 
 		 236 aa  47  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 757 aa  45.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  28.11 
 
 		 468 aa  45.8  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  22.78 
 
 		 250 aa  45.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  21.87 
 
 		 1147 aa  45.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  23.25 
 
 		 307 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  27.68 
 
 		 466 aa  45.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>